Instituto Universitario de Conservación y Mejora de la Agrodiversidad Valenciana

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Avances en la caracterización y desarrollo de marcadores moleculares ligados a la resistencia al tomato leaf curl New Delhi virus (ToLCNDV) en pepino (Cucumis sativus)
(Universitat Politècnica de València, 2022-08-03) Fernández Bonilla, Carmen María; López Del Rincón, Carmelo; Sáez Sánchez, Cristina; Dpto. de Biotecnología; Instituto Universitario de Conservación y Mejora de la Agrodiversidad Valenciana; Escuela Técnica Superior de Ingeniería Agronómica y del Medio Natural
[ES] El virus de la hoja rizada del tomate de Nueva Delhi (ToLCNDV) constituye una de las principales amenazas para el cultivo de cucurbitáceas en la cuenca del Mediterráneo. Dentro de esta familia hortícola, la producción de pepino (Cucumis sativus) se ha visto mermada por la incidencia de esta virosis. El uso de resistencias genéticas es la estrategia de control más eficiente para hacer frente a patógenos virales. Los grupos de Virología y Mejora Genética de Cucurbitáceas del COMAV-UPV identificaron accesiones de pepino resistentes a ToLCNDV y mapearon un QTL ligado a la resistencia en el cromosoma 2. Sin embargo, para la obtención de variedades comerciales con resistencia completa y durable a la infección es necesario el desarrollo de herramientas moléculares y la caracterización de nuevas fuentes de resistencia que permitan transferir y piramidalizar genes complementarios de resistencia a fondos genéticos de interés agronómico. El objetivo de este Trabajo Final de Máster consiste en profundizar en la caracterización genética de la resistencia a ToLCNDV. Para ello, se ha llevado a cabo la secuenciación mediante GBS de accesiones resistentes y susceptibles al virus, así como de plantas con diferente respuesta a la infección de una población segregante F2. Tras el análisis de los datos, se han identificado polimorfismos de tipo SNP localizados en la región del QTL ligado a la resistencia en pepino. Se han desarrollado marcadores SNPs para genotipar mediante tecnología ¿High Resolution Melting¿ (HRM) las poblaciones segregantes F2 y de retrocruce, lo que permitirá acotar la región candidata e identificar genes y marcadores moleculares estrechamente ligados a la resistencia. Por otra parte, se han obtenido semillas de tipo híbrido F1 derivadas de una accesión de pepino con resistencia a ToLCNDV de la que aún no se desconoce el tipo de herencia que la regula. Plantas F1 han sido cultivadas en invernadero y autofecundadas y retrocruzadas para generar poblaciones segregantes. Las plantas de las familias obtenidas se han inoculado con un clon infeccioso del virus y se han fenotipado según evaluación visual de su sintomatología. Para llevar a cabo un diagnóstico preciso de la enfermedad, la carga viral de cada planta ha sido evaluada mediante hibridación molecular con sondas de RNA y PCR cuantitativa. Los SNPs desarrollados a partir de la secuenciación por GBS se utilizarán para genotipar las nuevas poblaciones desarrolladas y validar si el locus del cromosoma 2 también controla la resistencia a ToLCNDV en esta accesión.
A bulk segregant gene expression analysis of a peach population reveals components of the underlying mechanism of the fruit cold response
(Public Library of Science, 2014-03) Pons Puig, Clara; Martí, Cristina; Forment Millet, José Javier; Crisosto, Carlos H.; Dandekar, Abhaya M.; Granell Richart, Antonio; Instituto Universitario Mixto de Biología Molecular y Celular de Plantas; Dpto. de Biotecnología; Instituto Universitario de Conservación y Mejora de la Agrodiversidad Valenciana; Escuela Técnica Superior de Ingeniería Agronómica y del Medio Natural; National Institute of Food and Agriculture, EEUU; U.S. - Israel Binational Agricultural Research and Development Fund; U.S. Department of Agriculture
Peach fruits subjected for long periods of cold storage are primed to develop chilling injury once fruits are shelf ripened at room temperature. Very little is known about the molecular changes occurring in fruits during cold exposure. To get some insight into this process a transcript profiling analyses was performed on fruits from a PopDG population segregating for chilling injury CI responses. A bulked segregant gene expression analysis based on groups of fruits showing extreme CI responses indicated that the transcriptome of peach fruits was modified already during cold storage consistently with eventual CI development. Most peach cold-responsive genes have orthologs in Arabidopsis that participate in cold acclimation and other stresses responses, while some of them showed expression patterns that differs in fruits according to their susceptibility to develop mealiness. Members of ICE1, CBF1/3 and HOS9 regulons seem to have a prominent role in differential cold responses between low and high sensitive fruits. In high sensitive fruits, an alternative cold response program is detected. This program is probably associated with dehydration/osmotic stress and regulated by ABA, auxins and ethylene. In addition, the observation that tolerant siblings showed a series of genes encoding for stress protective activities with higher expression both at harvest and during cold treatment, suggests that preprogrammed mechanisms could shape fruit ability to tolerate postharvest cold-induced stress. A number of genes differentially expressed were validated and extended to individual genotypes by medium-throughput RT-qPCR. Analyses presented here provide a global view of the responses of peach fruits to cold storage and highlights new peach genes that probably play important roles in the tolerance/sensitivity to cold storage. Our results provide a roadmap for further experiments and would help to develop new postharvest protocols and gene directed breeding strategies to better cope with chilling injury.
Comparación de métodos de detección de selección positiva
(Universitat Politècnica de València, 2019-07-22) Benegas Coll, Marta; Blanca Postigo, José Miguel; Dpto. de Biotecnología; Instituto Universitario de Conservación y Mejora de la Agrodiversidad Valenciana; Escuela Técnica Superior de Ingeniería Agronómica y del Medio Natural
[ES] Las especies cultivadas son fruto de un proceso de domesticación en el que los agricultores han ejercido una selección artificial en búsqueda de caracteres agronómicos de interés. Este proceso de selección afecta a la estructura de la variación genética presente en estas especies. Por ejemplo, en una región genómica seleccionada por favorecer la aparición de frutos grandes se seleccionará un alelo concreto en detrimento del resto. El objetivo de este trabajo es la comparación de diferentes software de búsqueda de marcas de selección a lo largo del genoma. La identificación de regiones que han sufrido selección podría utilizarse para localizar genes que son importantes durante el proceso de domesticación, información que puede resultar valiosa para los agricultores y mejoradores. En este trabajo se utiliza el tomate cultivado, Solanum lycopersicum, para estudiar el efecto del proceso de selección en el genoma, ya que se dispone de alrededor de 2000 muestras de tomate genotipadas, tanto de variedades tradicionales europeas como de especies silvestres relacionadas.
Root seedling morphology diversity in Capsicum spp
(University of Agricultural Sciences and Veterinary Medicine Cluj-Napoca, 2011) Peláez Andérica, Elena; Rodríguez Burruezo, Adrián; Prohens Tomás, Jaime; Fita Fernández, Ana María; Dpto. de Biotecnología; Instituto Universitario de Conservación y Mejora de la Agrodiversidad Valenciana; Escuela Técnica Superior de Ingeniería Agronómica y del Medio Natural
Sugar and acid profile of processing tomato cultivars grown under conventional or organic conditions
(International Society for Horticultural Science (ISHS), 2015) Leiva Brondo, Miguel; Martí, Raul; Macua, Juan Ignacio; Lahoz, Inmaculada; González, Ángel; Campillo, Carlos; ROSELLO RIPOLLES, SALVADOR; Cebolla Cornejo, Jaime; Dpto. de Biotecnología; Instituto Universitario de Conservación y Mejora de la Agrodiversidad Valenciana; Escuela Técnica Superior de Ingeniería Agronómica y del Medio Natural
The optimization of tomato taste has gained importance during the last years following consumer demands of higher quality. At the same time consumers also demand a minimum impact on the environment during cultivation. The effect of conventional and organic cultivation on the sugar and acid profile of processing cultivars has been studied in the two main growing regions in Spain. Standard and high lycopene cultivars have been used in order to study the possibility of combining organoleptic and functional quality. High differences in the acid profile (malic vs. citric) and in the sugar accumulation of the cultivars were found. In some cases, the higher values in the content of taste-related compounds coincide with previously described high lycopene contents. The cultivation system had no significant effect on malic and citric acid accumulation, but it affected sugar accumulation and the sucrose equivalents (SEq) to citric and glutamic acid ratios. On average, 7.7 and 10.4% higher contents of glucose and fructose respectively were obtained with the organic cultivation system. The SEq to citric acid and SEq to glutamic acid ratios were consequently higher with this system (8.3 and 46.3% respectively). Organic cultivation of high lycopene cultivars might be an excellent selection to combine high organoleptic and functional quality targeted to quality markets.
Abnormal Proventriculus in Bumble Bee Males
(MDPI AG, 2022-09) Ruiz González, Mario Javier; Dpto. de Biotecnología; Instituto Universitario de Conservación y Mejora de la Agrodiversidad Valenciana; Escuela Técnica Superior de Ingeniería Industrial; Science Foundation Ireland
[EN] Females social insects are widely investigated, while males are often neglected. Previous work on the morphology of the bumble bee male alimentary tract has described the presence of swollen proventriculi as a character with taxonomic value. New observations suggest that the abnormal proventriculus might be an abnormal condition. Here, I identify a potential health issue in bumble bee (Hymenoptera: Apidae: Bombus) male alimentary tracts that consists of a swollen and strongly melanized proventriculus, thereby preventing the normal passage of food through the esophageal valve. Males from three bumble bee species exhibited the abnormal proventriculus with an overall prevalence of 31.1% across two years. This finding challenges previous research that suggested the swollen and melanized proventriculus of Bombus males as a taxonomic character.
Moderate and severe water stress effects on morphological and biochemical traits in a set of pepino (Solanum muricatum) cultivars
(Elsevier, 2021-06-27) Pacheco, Juan; Plazas Ávila, María de la O; Pettinai, Ilaria; Landa-Faz, Anbu; González Orenga, Sara; Boscaiu Neagu, Mónica Tereza; Soler Aleixandre, Salvador; Prohens Tomás, Jaime; Vicente Meana, Óscar; Gramazio, Pietro; Dpto. de Ecosistemas Agroforestales; Dpto. de Biotecnología; Instituto Universitario de Conservación y Mejora de la Agrodiversidad Valenciana; Instituto Agroforestal Mediterráneo; Escuela Técnica Superior de Ingeniería Agronómica y del Medio Natural; Universitat Politècnica de València; Japan Society for the Promotion of Science
[EN] The pepino (Solanum muricatum) is a neglected crop from the Andean region with potential for expansion to many areas of the world. However, there is a lack of studies in pepino related to its response to water stress. In this study, we have subjected plantlets of seven pepino cultivars (Mur1-Mur7) to three treatments consisting of a fully irrigated control (C), a moderate water stress (WS-M), and a severe water stress (WS-S). Thirty-one traits related to growth, photosynthetic pigments, mono and divalent ions, osmolytes and antioxidants were measured. Significant differences were found among cultivars for most traits. The WS-M treatment did not affect most growth and biochemical parameters, while large differences with respect to the control were observed with the WS-S treatment. In general, the WS-S treatment induced an inhibition of the growth parameters, mainly the reduction of the fresh weight of leaves, stems and roots, as well as their water content. A principal component analysis (PCA) performed on the relative values of growth traits, together with the ANOVA for the traits for which significant interaction cultivar × treatment was detected, showed that cultivars Mur2 and Mur4 are the most tolerant to water stress. Although no clear-cut differences were observed among cultivars, the water-stressed plants of Mur2 and Mur4 displayed less variation with respect to the control than the other cultivars for the physiological and biochemical traits measured. Overall, photosynthetic pigments, malondialdehyde and total flavonoids decreased under severe water stress, while proline, Na+ and K+ contents increased significantly. The results obtained provide relevant information on the response to drought of pepino and have allowed identifying two cultivars better adapted to water stress that could be useful in breeding pepino for drought tolerance.
Determinación de las razas del mildiu de la lechuga (Bremia actucae) presentes en los cultivos de lechuga del sureste español
(Nova Ágora, 2015) Soler Aleixandre, Salvador; Figás Moreno, María del Rosario; Casanova Calancha, Cristina; Plazas Ávila, María de la O; Prohens Tomás, Jaime; Dpto. de Biotecnología; Instituto Universitario de Conservación y Mejora de la Agrodiversidad Valenciana; Escuela Técnica Superior de Ingeniería Agronómica y del Medio Natural
[ES] El hongo Bremia lactucae (mildiu de la lechuga) ocasiona una grave enfermedad en los cultivos de lechuga (Lactuca sativa). En este trabajo describimos las características de esta enfermedad y procedemos a la caracterización de 19 aislados de Bremia lactucae colectados en las zonas de producción de lechuga más importantes del sureste español. Estas son fundamentalmente el Campo de Cartagena, el Valle del Guadalentín, la zona de Aguilas-Mazarrón y la zona de Pulpí-Huercal-Overa. Las caracterizaciones efectuadas hasta el momento indican que la mayoría de los aislados constituyen razas diferentes entre sí y distintas de las razas catalogadas hasta el momento por el IBEB, de forma que se han identificado aislados correspondientes a 11 razas no catalogadas. Sólo seis de los aislados caracterizados coinciden según las inoculaciones realizadas hasta el momento, con la raza BL-24. Los trabajos efectuados aportan información de la composición de razas de B. lactucae en las zonas de producción de lechuga más importantes del estado español. Este conocimiento permitirá elegir por parte de los agricultores aquellas variedades de lechuga más adecuadas para el cultivo en las comarcas citadas, en función de las poblaciones de B. lactucae presentes en campo.
CÁLCULO DE LOS CIRCUITOS INTERIORES DE VIVIENDAS
(Universitat Politècnica de València, 2011-11-28) Martínez Antón, Alicia; Blanca Giménez, Vicente; Castilla Cabanes, Nuria; Pastor Villa, Rosa María; Dpto. de Construcciones Arquitectónicas; Escuela Técnica Superior de Arquitectura; Instituto Universitario de Conservación y Mejora de la Agrodiversidad Valenciana; Escuela Técnica Superior de Ingeniería de Edificación; Dpto. de Composición Arquitectónica; Centro de Investigación de Tecnología de la Edificación
En este artículo vamos a explicar cómo se dimensionan, paso a paso y a través de un ejemplo, los circuitos interiores de las viviendas. Emplearemos fórmulas y tablas que nos permitirán determinar los conductores y tubos adecuados. Al final se propone un ejercicio para poner en práctica lo aprendido. En el diseño y dimensionado de los circuitos interiores de una vivienda se deben tener en cuenta las prescripciones de las Instrucciones ITC-BT-25 y 26 del Reglamento Electrotécnico para Baja Tensión en lo referente a trazado, instalación, cálculo y características de los cables.
Resistencias a antibióticos en ejemplares de Blatella germanica
(Universitat Politècnica de València, 2015-09-07) Morote Faubel, Mireya; Vilanova Navarro, Santiago; Moya Simarro, Andrés; Dpto. de Biotecnología; Instituto Universitario de Conservación y Mejora de la Agrodiversidad Valenciana; Escuela Técnica Superior de Ingeniería Agronómica y del Medio Natural
[ES] El uso de antibióticos y antimicrobianos tan expandido es uno de los factores que propia la aparición de microorganismos multirresistentes, entre los que se incluyen diversas clases de patógenos. En este proyecto hemos investigado la existencia de genes de resistencia a antibióticos utilizando como modelo de estudio la microbiota intestinal de ejemplares recién capturados de cucaracha de la especie Blattella germanica, conocida como “Cucharacha alemana”. Por un lado, hemos comprobado la existencia de resistencias mediante técnicas habituales en los trabajos de microbiología para el cultivo de bacterias, concretamente mediante el aislamiento de las colonias resistentes que crecen en medio con una cierta concentración de antibiótico, utilizando antibióticos que se emplean en el tratamiento de importantes patologías humanas. Por otro lado, hemos empleado técnicas de secuenciación masiva nos ha demostrado una gran variedad de posibles resistencias, entre las que se encuentran las determinadas anteriormente mediante las técnicas de cultivo. Por los modos de acción tenemos un amplio espectro tanto de mecanismos de resistencia como de antibióticos a los que las bacterias no son sensibles. Algunas de las resistencias encontradas se encuentran diseminadas en gran variedad de especies de microorganismos, entre ellos muchos patógenos.